Mikroorganismer er tilsted i stort set alle dele af miljøet og inden i dyretarme væv af levende organismer, hvor de kan have stor indflydelse på værtens og miljøets tilstand på utallige måder.
DNA og RNA analyser af mikrobielle nukleotider indsamlet fra disse miljøer udgør en stor mulighed for at undersøge rolle og økologi af disse organismer og få øget forståelse for deres stofomsætning, funktion og evolutionære slægtskab.
